Navegação por autor "HUANG, ZHIWEI"

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  • IPEN-DOC 28909

    FERREIRA, MARIA C. de M.S.C.; LEAL, LEONARDO B.; NOGUEIRA, MARCELO S.; CASTRO, PEDRO A.A. ; PERALTA, FELIPE; ZEZELL, DENISE M. ; CARVALHO, LUIS F. das C. e S. de. Biochemical characterization of saliva of smoking and non-smoking patients by using Fourier-transform infrared spectroscopy. In: HUANG, ZHIWEI (Ed.) SPIE PHOTONICS WEST; SPIE BIOS, January 22 - February 28, 2022, San Francisco, CA, USA. Proceedings... Bellingham, WA, USA: SPIE, 2022. p. 119570E-1 - 119570E-12. (Proceedings SPIE 11957, Biomedical Vibrational Spectroscopy 2022: Advances in Research and Industry). DOI: 10.1117/12.2610565

    Abstract: More than 90% of oral malignant neoplasms consist of squamous cell carcinoma originated from extrinsic and/or intrinsic multifactorial etiology on the epithelium of the oral mucosa. This multifactorial etiology makes early-stage cancer detection challenging due to the lack of associated oral-tissue clinical features and absence of changes on conventional cellular-imaging, serological and histopathological exams. By using a molecular-sensitive optical technique such as Fourier-transform infrared (FT-IR) spectroscopy, disease-specific biochemical changes can be detected non-destructively, non-invasively and with small sample volumes. In this study, we have used FT-IR spectroscopy to analyze saliva samples of control, smoker, and occasional smoker groups and determine their intrinsic molecular changes as well as the performance of sample differentiation by using a neural network classifier. Saliva samples were collected by spitting, homogenized and stored at -20ºC until analysis. Spectral data was collected in the fingerprint region (900cm-1 to 1800cm- 1) by using a Thermo Scientific Nicolet 6700 ATR FT-IR Spectrometer, in which 1-μl samples were placed on the crystal without additives and left to dry completely by an average time of 5 minutes. Data pre-processing and analysis was performed on the OriginPro8.5 and Orange software. Saliva-sample classification was performed with leave-one-out validation. Correctly classified instances were 72.7% for the control group, 65.5% for occasional smokers and 75% for smokers. Sample differences were observed in the peaks at 1076cm-1 (skeletal cis conformation of DNA and symmetric stretching of phosphate [PO2], 1403cm-1 symmetric CH3 modes of protein methyl groups and δsCH3 of collagen, 1451cm- 1 asymmetrical CH3 bending modes of the protein methyl groups, 1547cm-1 of protein band, amide II, peptide and proteins amide II, and 1646cm-1 amide I, C5 methylated cytosine, C==O bond, C==C stretching uracil and NH2 guanine.

    Palavras-Chave: neoplasms; oral cavity; tobacco smokes; fourier transformation; infrared spectra; spectroscopy; biopsy; diagnostic techniques; tobacco

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Autor: Maprelian

Título: loss of coolant

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O gerenciamento do Repositório está a cargo da Biblioteca do IPEN. Constam neste RI, até o presente momento 20.950 itens que tanto podem ser artigos de periódicos ou de eventos nacionais e internacionais, dissertações e teses, livros, capítulo de livros e relatórios técnicos. Para participar do RI-IPEN é necessário que pelo menos um dos autores tenha vínculo acadêmico ou funcional com o Instituto. Nesta primeira etapa de funcionamento do RI, a coleta das publicações é realizada periodicamente pela equipe da Biblioteca do IPEN, extraindo os dados das bases internacionais tais como a Web of Science, Scopus, INIS, SciElo além de verificar o Currículo Lattes. O RI-IPEN apresenta também um aspecto inovador no seu funcionamento. Por meio de metadados específicos ele está vinculado ao sistema de gerenciamento das atividades do Plano Diretor anual do IPEN (SIGEPI). Com o objetivo de fornecer dados numéricos para a elaboração dos indicadores da Produção Cientifica Institucional, disponibiliza uma tabela estatística registrando em tempo real a inserção de novos itens. Foi criado um metadado que contém um número único para cada integrante da comunidade científica do IPEN. Esse metadado se transformou em um filtro que ao ser acionado apresenta todos os trabalhos de um determinado autor independente das variáveis na forma de citação do seu nome.

A elaboração do projeto do RI do IPEN foi iniciado em novembro de 2013, colocado em operação interna em julho de 2014 e disponibilizado na Internet em junho de 2015. Utiliza o software livre Dspace, desenvolvido pelo Massachusetts Institute of Technology (MIT). Para descrição dos metadados adota o padrão Dublin Core. É compatível com o Protocolo de Arquivos Abertos (OAI) permitindo interoperabilidade com repositórios de âmbito nacional e internacional.

1. Portaria IPEN-CNEN/SP nº 387, que estabeleceu os princípios que nortearam a criação do RDI, clique aqui.


2. A experiência do Instituto de Pesquisas Energéticas e Nucleares (IPEN-CNEN/SP) na criação de um Repositório Digital Institucional – RDI, clique aqui.

O Repositório Digital do IPEN é um equipamento institucional de acesso aberto, criado com o objetivo de reunir, preservar, disponibilizar e conferir maior visibilidade à Produção Científica publicada pelo Instituto, desde sua criação em 1956.

Operando, inicialmente como uma base de dados referencial o Repositório foi disponibilizado na atual plataforma, em junho de 2015. No Repositório está disponível o acesso ao conteúdo digital de artigos de periódicos, eventos, nacionais e internacionais, livros, capítulos, dissertações, teses e relatórios técnicos.

A elaboração do projeto do RI do IPEN foi iniciado em novembro de 2013, colocado em operação interna em julho de 2014 e disponibilizado na Internet em junho de 2015. Utiliza o software livre Dspace, desenvolvido pelo Massachusetts Institute of Technology (MIT). Para descrição dos metadados adota o padrão Dublin Core. É compatível com o Protocolo de Arquivos Abertos (OAI) permitindo interoperabilidade com repositórios de âmbito nacional e internacional.

O gerenciamento do Repositório está a cargo da Biblioteca do IPEN. Constam neste RI, até o presente momento 20.950 itens que tanto podem ser artigos de periódicos ou de eventos nacionais e internacionais, dissertações e teses, livros, capítulo de livros e relatórios técnicos. Para participar do RI-IPEN é necessário que pelo menos um dos autores tenha vínculo acadêmico ou funcional com o Instituto. Nesta primeira etapa de funcionamento do RI, a coleta das publicações é realizada periodicamente pela equipe da Biblioteca do IPEN, extraindo os dados das bases internacionais tais como a Web of Science, Scopus, INIS, SciElo além de verificar o Currículo Lattes. O RI-IPEN apresenta também um aspecto inovador no seu funcionamento. Por meio de metadados específicos ele está vinculado ao sistema de gerenciamento das atividades do Plano Diretor anual do IPEN (SIGEPI). Com o objetivo de fornecer dados numéricos para a elaboração dos indicadores da Produção Cientifica Institucional, disponibiliza uma tabela estatística registrando em tempo real a inserção de novos itens. Foi criado um metadado que contém um número único para cada integrante da comunidade científica do IPEN. Esse metadado se transformou em um filtro que ao ser acionado apresenta todos os trabalhos de um determinado autor independente das variáveis na forma de citação do seu nome.