Navegação por Revista "BMC Biotechnology"

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  • IPEN-DOC 14843

    RODRIGUES, DANIELLE B.; CHAMMAS, ROGER; MALAVASI, NATALIA V.; COSTA, PATRICIA L.N. da; CHURA-CHAMBI, ROSA M.; BALDUINO, KELI N.; MORGANTI, LIGIA . Anti-tumor therapy with macroencapsulated endostatin producer cells. BMC Biotechnology, v. 10, n. 19, p. 19-26, 2010.

    Palavras-Chave: neoplasms; therapy; encapsulation; animal cells; growth; inhibition; mice

  • IPEN-DOC 25191

    SILVA, CLEIDE M.R. da ; CHURA-CHAMBI, ROSA M. ; PEREIRA, LENNON R.; CORDEIRO, YRAIMA; FERREIRA, LUIS C. de S.; MORGANTI, LIGIA . Association of high pressure and alkaline condition for solubilization of inclusion bodies and refolding of the NS1 protein from zika virus. BMC Biotechnology, v. 18, n. 78, 2018. DOI: 10.1186/s12896-018-0486-2

    Abstract: Background: Proteins in inclusion bodies (IBs) present native-like secondary structures. However, chaotropic agents at denaturing concentrations, which are widely used for IB solubilization and subsequent refolding, unfold these secondary structures. Removal of the chaotropes frequently causes reaggregation and poor recovery of bioactive proteins. High hydrostatic pressure (HHP) and alkaline pH are two conditions that, in the presence of low level of chaotropes, have been described as non-denaturing solubilization agents. In the present study we evaluated the strategy of combination of HHP and alkaline pH on the solubilization of IB using as a model an antigenic form of the zika virus (ZIKV) non-structural 1 (NS1) protein. Results: Pressure-treatment (2.4 kbar) of NS1-IBs at a pH of 11.0 induced a low degree of NS1 unfolding and led to solubilization of the IBs, mainly into monomers. After dialysis at pH 8.5, NS1 was refolded and formed soluble oligomers. High (up to 68 mg/liter) NS1 concentrations were obtained by solubilization of NS1-IBs at pH 11 in the presence of arginine (Arg) with a final yield of approximately 80% of total protein content. The process proved to be efficient, quick and did not require further purification steps. Refolded NS1 preserved biological features regarding reactivity with antigen-specific antibodies, including sera of ZIKV-infected patients. The method resulted in an increase of approximately 30-fold over conventional IB solubilization-refolding methods. Conclusions: The present results represent an innovative non-denaturing protein refolding process by means of the concomitant use of HHP and alkaline pH. Application of the reported method allowed the recovery of ZIKV NS1 at a condition that maintained the antigenic properties of the protein.

    Palavras-Chave: zika virus; proteins; viral diseases; hydrostatics; pressure dependence; high pressure; ph value; alkaline hydrolysis

  • IPEN-DOC 10164

    BENTO, F.M.; TAKESHITA, D.; SACRAMENTO, C.B.; MACHADO, T.R.; MATHOR, M.B. ; CARMONA, A.K.; HAN, S.W.. Over expression of the selectable marker blasticidin S deaminase gene is toxic human keratinocytes and murine BALB/MK cells. BMC Biotechnology, v. 4, n. 1, p. 1-13, 2004.

    Palavras-Chave: genes; bacillus cereus; inactivation; plasmids; toxicity; mammals; cell killing; viruses; antibiotics; apoptosis

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É possível efetuar a busca de um autor ou um termo em todo o RD, por meio do Buscar no Repositório , isto é, o termo solicitado será localizado em qualquer campo do RD. No entanto esse tipo de pesquisa não é recomendada a não ser que se deseje um resultado amplo e generalizado.

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Exemplo:

Buscar os artigos apresentados em um evento internacional de 2015, sobre loss of coolant, do autor Maprelian.

Autor: Maprelian

Título: loss of coolant

Tipo de publicação: Texto completo de evento

Ano de publicação: 2015

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O RD disponibiliza um quadro estatístico de produtividade, onde é possível visualizar o número dos trabalhos agrupados por tipo de coleção, a medida que estão sendo depositados no RD.

Na página inicial nas referências são sinalizados todos os autores IPEN, ao clicar nesse símbolo será aberta uma nova página correspondente à aquele autor – trata-se da página do pesquisador.

Na página do pesquisador, é possível verificar, as variações do nome, a relação de todos os trabalhos com texto completo bem como um quadro resumo numérico; há links para o Currículo Lattes e o Google Acadêmico ( quando esse for informado).

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O gerenciamento do Repositório está a cargo da Biblioteca do IPEN. Constam neste RI, até o presente momento 20.950 itens que tanto podem ser artigos de periódicos ou de eventos nacionais e internacionais, dissertações e teses, livros, capítulo de livros e relatórios técnicos. Para participar do RI-IPEN é necessário que pelo menos um dos autores tenha vínculo acadêmico ou funcional com o Instituto. Nesta primeira etapa de funcionamento do RI, a coleta das publicações é realizada periodicamente pela equipe da Biblioteca do IPEN, extraindo os dados das bases internacionais tais como a Web of Science, Scopus, INIS, SciElo além de verificar o Currículo Lattes. O RI-IPEN apresenta também um aspecto inovador no seu funcionamento. Por meio de metadados específicos ele está vinculado ao sistema de gerenciamento das atividades do Plano Diretor anual do IPEN (SIGEPI). Com o objetivo de fornecer dados numéricos para a elaboração dos indicadores da Produção Cientifica Institucional, disponibiliza uma tabela estatística registrando em tempo real a inserção de novos itens. Foi criado um metadado que contém um número único para cada integrante da comunidade científica do IPEN. Esse metadado se transformou em um filtro que ao ser acionado apresenta todos os trabalhos de um determinado autor independente das variáveis na forma de citação do seu nome.

A elaboração do projeto do RI do IPEN foi iniciado em novembro de 2013, colocado em operação interna em julho de 2014 e disponibilizado na Internet em junho de 2015. Utiliza o software livre Dspace, desenvolvido pelo Massachusetts Institute of Technology (MIT). Para descrição dos metadados adota o padrão Dublin Core. É compatível com o Protocolo de Arquivos Abertos (OAI) permitindo interoperabilidade com repositórios de âmbito nacional e internacional.

1. Portaria IPEN-CNEN/SP nº 387, que estabeleceu os princípios que nortearam a criação do RDI, clique aqui.


2. A experiência do Instituto de Pesquisas Energéticas e Nucleares (IPEN-CNEN/SP) na criação de um Repositório Digital Institucional – RDI, clique aqui.

O Repositório Digital do IPEN é um equipamento institucional de acesso aberto, criado com o objetivo de reunir, preservar, disponibilizar e conferir maior visibilidade à Produção Científica publicada pelo Instituto, desde sua criação em 1956.

Operando, inicialmente como uma base de dados referencial o Repositório foi disponibilizado na atual plataforma, em junho de 2015. No Repositório está disponível o acesso ao conteúdo digital de artigos de periódicos, eventos, nacionais e internacionais, livros, capítulos, dissertações, teses e relatórios técnicos.

A elaboração do projeto do RI do IPEN foi iniciado em novembro de 2013, colocado em operação interna em julho de 2014 e disponibilizado na Internet em junho de 2015. Utiliza o software livre Dspace, desenvolvido pelo Massachusetts Institute of Technology (MIT). Para descrição dos metadados adota o padrão Dublin Core. É compatível com o Protocolo de Arquivos Abertos (OAI) permitindo interoperabilidade com repositórios de âmbito nacional e internacional.

O gerenciamento do Repositório está a cargo da Biblioteca do IPEN. Constam neste RI, até o presente momento 20.950 itens que tanto podem ser artigos de periódicos ou de eventos nacionais e internacionais, dissertações e teses, livros, capítulo de livros e relatórios técnicos. Para participar do RI-IPEN é necessário que pelo menos um dos autores tenha vínculo acadêmico ou funcional com o Instituto. Nesta primeira etapa de funcionamento do RI, a coleta das publicações é realizada periodicamente pela equipe da Biblioteca do IPEN, extraindo os dados das bases internacionais tais como a Web of Science, Scopus, INIS, SciElo além de verificar o Currículo Lattes. O RI-IPEN apresenta também um aspecto inovador no seu funcionamento. Por meio de metadados específicos ele está vinculado ao sistema de gerenciamento das atividades do Plano Diretor anual do IPEN (SIGEPI). Com o objetivo de fornecer dados numéricos para a elaboração dos indicadores da Produção Cientifica Institucional, disponibiliza uma tabela estatística registrando em tempo real a inserção de novos itens. Foi criado um metadado que contém um número único para cada integrante da comunidade científica do IPEN. Esse metadado se transformou em um filtro que ao ser acionado apresenta todos os trabalhos de um determinado autor independente das variáveis na forma de citação do seu nome.