Navegação por Revista "International Journal of Molecular Sciences"

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  • IPEN-DOC 20832

    LIMA, CASSIO A.; GOULART, VIVIANE P. ; CORREA, LUCIANA; PEREIRA, THIAGO M. ; ZEZELL, DENISE M. . ATR-FTIR spectroscopy for the assessment of biochemical changes in skin due to cutaneous squamous cell carcinoma. International Journal of Molecular Sciences, v. 16, n. 4, p. 6621-6630, 2015.

    Palavras-Chave: fourier transform spectrometers; infrared spectra; skin; carcinomas; laser spectroscopy; mice; in vivo

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  • IPEN-DOC 27384

    COUTO, VERONICA M.; OLIVEIRA-NASCIMENTO, LAURA de; CABEÇA, LUIZ F.; GERALDES, DANILO C.; COSTA, JULIANA S.R.; RISKE, KARIN A.; FRANZ-MONTAN, MICHELLE; YOKAYCHIYA, FABIANO ; FRANCO, MARGARETH K.K.D. ; PAULA, ENEIDA de. Capsaicin-cyclodextrin complex enhances mepivacaine targeting and improves local anesthesia in inflamed tissues. International Journal of Molecular Sciences, v. 21, n. 16, p. 1-18, 2020. DOI: 10.3390/ijms21165741

    Abstract: Acidic environments, such as in inflamed tissues, favor the charged form of local anesthetics (LA). Hence, these drugs show less cell permeation and diminished potency. Since the analgesic capsaicin (CAP) triggers opening of the TRPV1 receptor pore, its combination with LAs could result in better uptake and improved anesthesia. We tested the above hypothesis and report here for the first time the analgesia effect of a two-drug combination (LA and CAP) on an inflamed tissue. First, CAP solubility increased up to 20 times with hydroxypropyl-beta-cyclodextrin (HP-β-CD), as shown by the phase solubility study. The resulting complex (HP-β-CD-CAP) showed 1:1 stoichiometry and high association constant, according to phase-solubility diagrams and isothermal titration calorimetry data. The inclusion complex formation was also confirmed and characterized by differential scanning calorimetry (DSC), X-ray diffraction, and 1H-NMR. The freeze-dried complex showed physicochemical stability for at least 12 months. To test in vivo performance, we used a pain model based on mouse paw edema. Results showed that 2% mepivacaine injection failed to anesthetize mice inflamed paw, but its combination with complexed CAP resulted in pain control up to 45 min. These promising results encourages deeper research of CAP as an adjuvant for anesthesia in inflamed tissues and cyclodextrin as a solubilizing agent for targeting molecules in drug delivery.

    Palavras-Chave: anesthesia; inflammation; anesthetics; dextrin; scanning electron microscopy; differential thermal analysis; calorimetry

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  • IPEN-DOC 29607

    MARTINS, LUCIANE; LESSA, LUIS G.F.; ALI, TACCYANNA M.; LAZAR, MONIZE; KIM, CHONG A.; KANTOVITZ, KAMILA R.; SANTAMARIA, MAURO P.; ARAUJO, CASSIA F.; RAMOS, CAROLINA J.; FOSTER, BRIAN L.; FRANCO, JOSE F.S. ; BERTOLA, DEBORA; NOCITI JUNIOR, FRANCISCO H.. Childhood hypophosphatasia associated with a novel biallelic ALPL variant at the TNSALP dimer interface. International Journal of Molecular Sciences, v. 24, n. 1, p. 1-10, 2023. DOI: 10.3390/ijms24010282

    Abstract: The goal of this study was to perform a clinical and molecular investigation in an eight-year-old female child diagnosed with hypophosphatasia (HPP). The proband and her family were evaluated by medical and dental histories, biochemical analyses, radiographic imaging, and genetic analysis of the tissue-nonspecific alkaline phosphatase (ALPL) gene. A bioinformatic analysis was performed to predict the structural and functional impact of the point mutations in the tissue-nonspecific alkaline phosphatase (TNSALP) molecule and to define their potential contribution to the phenotype. We identified a novel combination of heterozygous ALPL missense variants in the proband, p.Ala33Val and p.Asn47His, compatible with an autosomal recessive mode of inheritance and resulting in skeletal and dental phenotypes. Computational modeling showed that the affected Asn47 residue is located in the coil structure close to the N-terminal α-helix, whereas the affected Ala33 residue is localized in the N-terminal α-helix. Both affected residues are located close to the homodimer interface, suggesting they may impair TNSALP dimer formation and stability. Clinical and biochemical follow-up revealed improvements after six years of ERT. Reporting this novel combination of ALPL variants in childhood HPP provides new insights into genotype–phenotype associations for HPP and specific sites within the TNSALP molecule potentially related to a childhood-onset HPP and skeletal and dental manifestations. Beneficial effects of ERT are implicated in skeletal and dental tissues.

    Palavras-Chave: genotype; phenotype; alkaline phosphatase; hereditary diseases; dentistry; teeth; children; 3d printing

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  • IPEN-DOC 23506

    SILVA, ROSEMEIRE A.; GIORDANO, RICARDO J.; GUTIERREZ, PAULO S.; ROCHA, VIVIANE Z.; RUDNICKI, MARTINA; KEE, PATRICK; ABDALLA, DULCINEIA S.P.; PUECH-LEAO, PEDRO; CARAMELLI, BRUNO; ARAP, WADIH; PASQUALINI, RENATA; MENEGHETTI, JOSE C.; MARQUES, FABIO L.N.; KHOOBCHANDANI, MENKA; KATTI, KATTESH V.; LUGAO, ADEMAR B. ; KALIL, JORGE. CTHRSSVVC peptide as a possible early molecular imaging target for atherosclerosis. International Journal of Molecular Sciences, v. 17, n. 9, p. 1-18, 2016. DOI: 10.3390/ijms17091383

    Abstract: The purpose of our work was to select phages displaying peptides capable of binding to vascular markers present in human atheroma, and validate their capacity to target the vascular markers in vitro and in low-density lipoprotein receptor knockout (LDLr􀀀/􀀀) mouse model of atherosclerosis. By peptide fingerprinting on human atherosclerotic tissues, we selected and isolated four different peptides sequences, which bind to atherosclerotic lesions and share significant similarity to known human proteins with prominent roles in atherosclerosis. The CTHRSSVVC-phage peptide displayed the strongest reactivity with human carotid atherosclerotic lesions (p < 0.05), when compared to tissues from normal carotid arteries. This peptide sequence shares similarity to a sequence present in the fifth scavenger receptor cysteine-rich (SRCR) domain of CD163, which appeared to bind to CD163, and subsequently, was internalized by macrophages. Moreover, the CTHRSSVVC-phage targets atherosclerotic lesions of a low-density lipoprotein receptor knockout (LDLr􀀀/􀀀) mouse model of atherosclerosis in vivo to High-Fat diet group versus Control group. Tetraazacyclododecane-1,4,7,10-tetraacetic acid-CTHRSSVVC peptide (DOTA-CTHRSSVVC) was synthesized and labeled with 111InCl3 in >95% yield as determined by high performance liquid chromatography (HPLC), to validate the binding of the peptide in atherosclerotic plaque specimens. The results supported our hypothesis that CTHRSSVVC peptide has a remarkable sequence for the development of theranostics approaches in the treatment of atherosclerosis and other diseases.

    Palavras-Chave: arteriosclerosis; peptides; macrophages; proteins; theranostics

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  • IPEN-DOC 29502

    SARDO, ARIANE V.N. ; ANDRADE, MAIRA F. ; FIGUEIREDO, ANAELIZA; ROSIN, FLAVIA C.P.; CORREA, LUCIANA; ZEZELL, DENISE M. . Does photobiomodulation affects CK10 and CK14 in oral mucositis radioinduced repair?. International Journal of Molecular Sciences, v. 23, n. 24, p. 1-9, 2022. DOI: 10.3390/ijms232415611

    Abstract: The mechanisms of action of photobiomodulation (PBM) in oral mucositis (OM) are not completely elucidated. To enlighten the role of PBM in the evolution of epithelial maturity in OM ulcers, the present study evaluated the effect of PBM with red ( ) wavelength of 660 nanometers (nm) and infrared of 780 nm in radio-induced OM wounds on the tongue of rats, eight and twenty days after irradiation with single dose of 20 Gy. The percentage area corresponding to positive staining for cytokeratin 10 (CK10) and 14 (CK14) proteins was evaluated in the epithelial area of the lesions, using an immunohistochemical technique (IHC), 8 and 20 days after the induction of lesions, and compared with an untreated control group. CK10 was significantly more expressed in the group treated with 660 nm PBM. CK14 did not show quantitative differences between the groups evaluated. However, whereas in the groups treated with PBM, CK14 was already restricted to the basal layer of the epithelium, as expected in healthy epithelia, in control group it was also expressed in upper layers of the epithelium. In this work, PBM was able to improve epithelial maturity of the repaired OM wound, especially in the 660 nm group.

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  • IPEN-DOC 13831

    DIREITO, GLORIA M.; ALMEIDA, ADRIANA P.; AQUINO, SIMONE; REIS, TATIANA A. dos; POZZI, CLÁUDIA R.; CORREA, BENEDITO. Evaluation of sphingolipids in wistar rats treated to prolonged and single oral doses of fumonisin Bsub(1). International Journal of Molecular Sciences, v. 10, n. 1, p. 50-61, 2009.

    Palavras-Chave: fusarium; sphingomyelins; biological markers; rats; single intake; biological effects

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  • IPEN-DOC 22995

    RIBELA, MARIA T.C.P. ; DAMIANI, RENATA ; SILVA, FELIPE D. ; LIMA, ELIANA R. ; OLIVEIRA, JOAO E. ; PERONI, CIBELE N. ; TORJESEN, PETER A.; SOARES, CARLOS R. ; BARTOLINI, PAOLO . N-Glycoprofiling analysis for carbohydrate composition and site-occupancy determination in a poly-glycosylated protein: human thyrotropin of different origins. International Journal of Molecular Sciences, v. 18, n. 131, p. 1-15, 2017. DOI: 10.3390/ijms18020131

    Abstract: Human thyrotropin (hTSH) is a glycoprotein with three potential glycosylation sites: two in the -subunit and one in the -subunit. These sites are not always occupied and occupancy is frequently neglected in glycoprotein characterization, even though it is related to folding, trafficking, initiation of inflammation and host defense, as well as congenital disorders of glycosylation (CDG). For the first time N-glycoprofiling analysis was applied to the site-occupancy determination of two native pituitary hTSH, in comparison with three recombinant preparations of hTSH, a widely used biopharmaceutical. A single methodology provided the: (i) average N-glycan mass; (ii) mass fraction of each monosaccharide and of sulfate; and (iii) percent carbohydrate. The results indicate that the occupancy (65%–87%) and carbohydrate mass (12%–19%) can be up to 34%–57% higher in recombinant hormones. The average glycan mass is 24% lower in pituitary hTSH and contains ~3-fold fewer moles of galactose (p < 0.005) and sialic acid (p < 0.01). One of the two native preparations, which had the smallest glycan mass together with the lowest occupancy and GalNAc, sulfate, Gal and sialic acid contents, also presented the lowest in vivo bioactivity and circulatory half-life. The methodology described, comparing a recombinant biopharmaceutical to its native equivalent, can be applied to any physiologically or clinical relevant glycoprotein.

    Palavras-Chave: glycoproteins; trh; tsh; carbohydrates; mass spectroscopy; pharmacology; radioimmunoassay; cho cells

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  • IPEN-DOC 24777

    PEREIRA, DAISA L. ; FREITAS, ANDERSON Z. ; BACHMANN, LUCIANO; BENETTI, CAROLINA; ZEZELL, DENISE M. ; ANA, PATRICIA A.. Variation on molecular structure, crystallinity, and optical properties of dentin due to Nd:YAG laser and fluoride aimed at tooth erosion prevention. International Journal of Molecular Sciences, v. 19, n. 2, 2018. DOI: 10.3390/ijms19020433

    Abstract: This in vitro study evaluated the compositional, crystalline, and morphological effects promoted by Nd:YAG laser on root dentin, and verified the effects of laser and topical acidulated phosphate fluoride application (APF-gel) on dentin erosion. 180 bovine dentin slabs were randomized into 4 groups (n = 45): G1–untreated, G2–APF-gel (1.23% F−, 4 min), G3–Nd:YAG (1064 nm, 84.9 J/cm2, 10 Hz), and G4–APF-gel application followed by Nd:YAG laser irradiation. The compositional, crystalline, and morphological effects promoted by treatments were investigated on five samples of each experimental group. The other samples were submitted to a 5-day, 10-day, or 15-day erosive and abrasive demineralization and remineralization cycling in order to create erosion lesions. The area and depth of lesions, as well as the optical attenuation coefficient, were assessed, and all data were statistically analysed (p < 0.05). Nd:YAG laser promoted the reduction of carbonate, the formation of tetracalcium phosphate, as well as the melting and recrystallization of the dentin surface. Laser significantly decreased the area and depth of erosion lesions and altered the optical attenuation coefficient when compared to untreated and APF-gel groups, but the association of APF-gel and laser did not promote an additional effect. Nd:YAG laser irradiation can be a promissory treatment to prevent dentin erosion and the abrasion process.

    Palavras-Chave: molecular structure; dentin; abrasion; demineralization; crystallography; fluorides; neodymium lasers; laser radiation; erosion; teeth; dentistry; infrared radiation

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O gerenciamento do Repositório está a cargo da Biblioteca do IPEN. Constam neste RI, até o presente momento 20.950 itens que tanto podem ser artigos de periódicos ou de eventos nacionais e internacionais, dissertações e teses, livros, capítulo de livros e relatórios técnicos. Para participar do RI-IPEN é necessário que pelo menos um dos autores tenha vínculo acadêmico ou funcional com o Instituto. Nesta primeira etapa de funcionamento do RI, a coleta das publicações é realizada periodicamente pela equipe da Biblioteca do IPEN, extraindo os dados das bases internacionais tais como a Web of Science, Scopus, INIS, SciElo além de verificar o Currículo Lattes. O RI-IPEN apresenta também um aspecto inovador no seu funcionamento. Por meio de metadados específicos ele está vinculado ao sistema de gerenciamento das atividades do Plano Diretor anual do IPEN (SIGEPI). Com o objetivo de fornecer dados numéricos para a elaboração dos indicadores da Produção Cientifica Institucional, disponibiliza uma tabela estatística registrando em tempo real a inserção de novos itens. Foi criado um metadado que contém um número único para cada integrante da comunidade científica do IPEN. Esse metadado se transformou em um filtro que ao ser acionado apresenta todos os trabalhos de um determinado autor independente das variáveis na forma de citação do seu nome.

A elaboração do projeto do RI do IPEN foi iniciado em novembro de 2013, colocado em operação interna em julho de 2014 e disponibilizado na Internet em junho de 2015. Utiliza o software livre Dspace, desenvolvido pelo Massachusetts Institute of Technology (MIT). Para descrição dos metadados adota o padrão Dublin Core. É compatível com o Protocolo de Arquivos Abertos (OAI) permitindo interoperabilidade com repositórios de âmbito nacional e internacional.

1. Portaria IPEN-CNEN/SP nº 387, que estabeleceu os princípios que nortearam a criação do RDI, clique aqui.


2. A experiência do Instituto de Pesquisas Energéticas e Nucleares (IPEN-CNEN/SP) na criação de um Repositório Digital Institucional – RDI, clique aqui.

O Repositório Digital do IPEN é um equipamento institucional de acesso aberto, criado com o objetivo de reunir, preservar, disponibilizar e conferir maior visibilidade à Produção Científica publicada pelo Instituto, desde sua criação em 1956.

Operando, inicialmente como uma base de dados referencial o Repositório foi disponibilizado na atual plataforma, em junho de 2015. No Repositório está disponível o acesso ao conteúdo digital de artigos de periódicos, eventos, nacionais e internacionais, livros, capítulos, dissertações, teses e relatórios técnicos.

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