Navegação IPEN por autor "WAINWRIGHT, MARK"

Classificar por: Ordenar: Resultados:

  • IPEN-DOC 27154

    SABINO, CAETANO P.; WAINWRIGHT, MARK; RIBEIRO, MARTHA S. ; SELLERA, FABIO P.; ANJOS, CAROLINA dos; BAPTISTA, MAURICIO da S.; LINCOPAN, NILTON. Global priority multidrug-resistant pathogens do not resist photodynamic therapy. Journal of Photochemistry and Photobiology B: Biology, v. 208, p. 1-9, 2020. DOI: 10.1016/j.jphotobiol.2020.111893

    Abstract: Microbial drug-resistance demands immediate implementation of novel therapeutic strategies. Antimicrobial photodynamic therapy (aPDT) combines the administration of a photosensitizer (PS) compound with low-irradiance light to induce photochemical reactions that yield reactive oxygen species (ROS). Since ROS react with nearly all biomolecules, aPDT offers a powerful multitarget method to avoid selection of drug-resistant strains. In this study, we assayed photodynamic inactivation under a standardized method, combining methylene blue (MB) as PS and red light, against global priority pathogens. The species tested include Acinetobacter baumannii, Klebsiella aerogenes, Escherichia coli, Klebsiella pneumoniae, Pseudomonas aeruginosa, Enterococcus faecium, Enterococcus faecalis, Staphylococcus aureus, Candida albicans and Cryptococcus neoformans. Our strain collection presents resistance to all tested antimicrobials (> 50). All drug-resistant strains were compared to their drugsensitive counterparts. Regardless of resistance phenotype, MB-aPDT presented species-specific dose-response kinetics. More than 5log10 reduction was observed within less than 75 s of illumination for A. baumannii, E. coli, E. faecium, E. faecalis and S. aureus and within less than 7 min for K. aerogenes, K. pneumoniae, P. aeruginosa, C. albicans and C. neoformans. No signs of correlations in between drug-resistance profiles and aPDT sensitivity were observed. Therefore, MB-aPDT can provide effective therapeutic protocols for a very broad spectrum of pathogens. Hence, we believe that this study represents a very important step to bring aPDT closer to implementation into mainstream medical practices.

    Palavras-Chave: microbial drug resistance; photosensitivity; therapy; bacteria; antimicrobial agents; radiant flux density; light sources; inactivation

  • IPEN-DOC 26453

    SABINO, CAETANO P.; WAINWRIGHT, MARK; ANJOS, CAROLINA dos; SELLERA, FABIO P.; BAPTISTA, MAURICIO S.; LINCOPAN, NILTON; RIBEIRO, MARTHA S. . Inactivation kinetics and lethal dose analysis of antimicrobial blue light and photodynamic therapy. Photodiagnosis and Photodynamic Therapy, v. 28, p. 186-191, 2019. DOI: 10.1016/j.pdpdt.2019.08.022

    Abstract: Background: Antimicrobial Photodynamic therapy (A-PDT) has been used to treat infections. Currently, microbial inactivation data is reported presenting survival fraction averages and standard errors as discrete points instead of a continuous curve of inactivation kinetics. Standardization of this approach would allow clinical protocols to be introduced globally, instead of the piecemeal situation which currently applies. Methods: To this end, we used a power-law function to fit inactivation kinetics and directly report values of lethal doses (LD) and a tolerance factor (T) that informs if inactivation rate varies along the irradiation procedure. A deduced formula was also tested to predict LD for any given survival fraction value. We analyzed the photoantimicrobial effect caused by red light activation of methylene blue (MB-APDT) and by blue light (BL) activation of endogenous microbial pigments against 5 clinically relevant pathogens. Results: Following MB- APDT, Escherichia coli and Staphylococcus aureus cells become increasingly more tolerant to inactivation along the irradiation process (T < 1). Klebsiella pneumoniae presents opposite behavior, i.e., more inactivation is observed towards the end of the process (T > 1). P. aeruginosa and Candida albicans present constant inactivation rate (T˜1). In contrast, all bacterial species presented similar behavior during inactivation caused by BL, i.e., continuously becoming more sensitive to blue light exposure (T > 1). Conclusion: The power-law function successfully fit all experimental data. Our proposed method precisely predicted LD and T values. We expect that these analytical models may contribute to more standardized methods for comparisons of photodynamic inactivation efficiencies.

    Palavras-Chave: antimicrobial agents; therapy; chemotherapy; inactivation; lethal doses; light sources; data analysis; candida; methylene blue

  • IPEN-DOC 27394

    SABINO, CAETANO P.; BALL, ANTHONY R.; BAPTISTA, MAURICIO S.; DAI, TIANHONG; HAMBLIN, MICHAEL R.; RIBEIRO, MARTHA S. ; SANTOS, ANA L.; SELLERA, FABIO P.; TEGOS, GEORGE P.; WAINWRIGHT, MARK. Light-based technologies for management of COVID-19 pandemic crisis. Journal of Photochemistry and Photobiology B: Biology, v. 212, p. 1-8, 2020. DOI: 10.1016/j.jphotobiol.2020.111999

    Abstract: The global dissemination of the novel coronavirus disease (COVID-19) has accelerated the need for the implementation of effective antimicrobial strategies to target the causative agent SARS-CoV-2. Light-based technologies have a demonstrable broad range of activity over standard chemotherapeutic antimicrobials and conventional disinfectants, negligible emergence of resistance, and the capability to modulate the host immune response. This perspective article identifies the benefits, challenges, and pitfalls of repurposing light-based strategies to combat the emergence of COVID-19 pandemic.

    Palavras-Chave: visible radiation; coronaviruses; ultraviolet radiation; antimicrobial agents; inactivation; photosensitivity; modulation; radiobiology; epidemiology; lasers; viruses

  • IPEN-DOC 25810

    ALVARENGA, LETICIA H.; GOMES, ANA C.; CARRIBEIRO, PAMELA; GODOY-MIRANDA, BIANCA; NOSCHESE, GIOVANE; RIBEIRO, MARTHA S. ; KATO, ILKA T.; BUSSADORI, SANDRA K.; PAVANI, CHRISTIANE; GERALDO, YHAGO G.E.; SILVA, DANIELA de F.T. da; HORLIANA, ANNA C.R.T.; WAINWRIGHT, MARK; PRATES, RENATO A.. Parameters for antimicrobial photodynamic therapy on periodontal pocket: randomized clinical trial. Photodiagnosis and Photodynamic Therapy, v. 27, p. 132-136, 2019. DOI: 10.1016/j.pdpdt.2019.05.035

    Abstract: Background: Antimicrobial photodynamic therapy (aPDT) has been investigated as an adjunctive to periodontal treatment but the dosimetry parameters adopted have discrepancies and represent a challenge to measure efficacy. There is a need to understand the clinical parameters required to obtain antimicrobial effects by using aPDT in periodontal pockets. The aim of this study was to investigate parameters relating to the antimicrobial effects of photodynamic therapy in periodontal pockets. Material and methods: This randomized controlled clinical trial included 30 patients with chronic periodontitis. Three incisors from each patient were selected and randomized for the experimental procedures. Microbiological evaluations were performed to quantify microorganisms before and after treatments and spectroscopy was used to identify methylene blue in the pocket. A laser source with emission of radiation at wavelength of ʎ=660 nm and output radiant power of 100mW was used for 1, 3 and 5 min. One hundred μM methylene blue was used in aqueous solution and on surfactant vehicle. Results: The results demonstrated the absence of any antimicrobial effect with aqueous methylene blue-mediated PDT. On the other hand, methylene blue in the surfactant vehicle produced microbial reduction in the group irradiated for 5 min (p < 0.05). Spectroscopy showed that surfactant vehicle decreased the dimer peak signal at 610 nm. Conclusion: Within the parameters used in this study, PDT mediated by methylene blue in a surfactant vehicle reached significant microbial reduction levels with 5 min of irradiation. The clinical use of PDT may be limited by factors that reduce the antimicrobial effect. Forms of irradiation and stability of the photosensitizers play an important role in clinical aPDT.

    Palavras-Chave: methylene blue; antimicrobial agents; dosimetry; clinical trials; therapy; dentistry; bacteria; irradiation; absorption

  • IPEN-DOC 29636

    SABINO, CAETANO P.; RIBEIRO, MARTHA S. ; WAINWRIGHT, MARK; ANJOS, CAROLINA dos; SELLERA, FABIO P.; DROPA, MILENA; NUNES, NATHALIA B.; BRANCINI, GUILHERME T.P.; BRAGA, GILBERTO U.L.; ARANA-CHAVEZ, VICTOR E.; FREITAS, RAUL O.; LINCOPAN, NILTON; BAPTISTA, MAURICIO S.. The biochemical mechanisms of antimicrobial photodynamic therapy. Photochemistry and Photobiology, v. 99, n. 2, p. 742-750, 2023. DOI: 10.1111/php.13685

    Abstract: The unbridled dissemination of multidrug-resistant pathogens is a major threat to global health and urgently demands novel therapeutic alternatives. Antimicrobial photodynamic therapy (aPDT) has been developed as a promising approach to treat localized infections regardless of drug resistance profile or taxonomy. Even though this technique has been known for more than a century, discussions and speculations regarding the biochemical mechanisms of microbial inactivation have never reached a consensus on what is the primary cause of cell death. Since photochemically generated oxidants promote ubiquitous reactions with various biomolecules, researchers simply assumed that all cellular structures are equally damaged. In this study, biochemical, molecular, biological and advanced microscopy techniques were employed to investigate whether protein, membrane or DNA damage correlates better with dose-dependent microbial inactivation kinetics. We showed that although mild membrane permeabilization and late DNA damage occur, no correlation with inactivation kinetics was found. On the other hand, protein degradation was analyzed by three different methods and showed a dose-dependent trend that matches microbial inactivation kinetics. Our results provide a deeper mechanistic understanding of aPDT that can guide the scientific community toward the development of optimized photosensitizing drugs and also rationally propose synergistic combinations with antimicrobial chemotherapy.

    Palavras-Chave: antimicrobial agents; photodynamic therapy; biochemical reaction kinetics; microbial drug resistance

A pesquisa no RD utiliza os recursos de busca da maioria das bases de dados. No entanto algumas dicas podem auxiliar para obter um resultado mais pertinente.

É possível efetuar a busca de um autor ou um termo em todo o RD, por meio do Buscar no Repositório , isto é, o termo solicitado será localizado em qualquer campo do RD. No entanto esse tipo de pesquisa não é recomendada a não ser que se deseje um resultado amplo e generalizado.

A pesquisa apresentará melhor resultado selecionando um dos filtros disponíveis em Navegar

Os filtros disponíveis em Navegar tais como: Coleções, Ano de publicação, Títulos, Assuntos, Autores, Revista, Tipo de publicação são autoexplicativos. O filtro, Autores IPEN apresenta uma relação com os autores vinculados ao IPEN; o ID Autor IPEN diz respeito ao número único de identificação de cada autor constante no RD e sob o qual estão agrupados todos os seus trabalhos independente das variáveis do seu nome; Tipo de acesso diz respeito à acessibilidade do documento, isto é , sujeito as leis de direitos autorais, ID RT apresenta a relação dos relatórios técnicos, restritos para consulta das comunidades indicadas.

A opção Busca avançada utiliza os conectores da lógica boleana, é o melhor recurso para combinar chaves de busca e obter documentos relevantes à sua pesquisa, utilize os filtros apresentados na caixa de seleção para refinar o resultado de busca. Pode-se adicionar vários filtros a uma mesma busca.

Exemplo:

Buscar os artigos apresentados em um evento internacional de 2015, sobre loss of coolant, do autor Maprelian.

Autor: Maprelian

Título: loss of coolant

Tipo de publicação: Texto completo de evento

Ano de publicação: 2015

Para indexação dos documentos é utilizado o Thesaurus do INIS, especializado na área nuclear e utilizado em todos os países membros da International Atomic Energy Agency – IAEA , por esse motivo, utilize os termos de busca de assunto em inglês; isto não exclui a busca livre por palavras, apenas o resultado pode não ser tão relevante ou pertinente.

95% do RD apresenta o texto completo do documento com livre acesso, para aqueles que apresentam o significa que e o documento está sujeito as leis de direitos autorais, solicita-se nesses casos contatar a Biblioteca do IPEN, bibl@ipen.br .

Ao efetuar a busca por um autor o RD apresentará uma relação de todos os trabalhos depositados no RD. No lado direito da tela são apresentados os coautores com o número de trabalhos produzidos em conjunto bem como os assuntos abordados e os respectivos anos de publicação agrupados.

O RD disponibiliza um quadro estatístico de produtividade, onde é possível visualizar o número dos trabalhos agrupados por tipo de coleção, a medida que estão sendo depositados no RD.

Na página inicial nas referências são sinalizados todos os autores IPEN, ao clicar nesse símbolo será aberta uma nova página correspondente à aquele autor – trata-se da página do pesquisador.

Na página do pesquisador, é possível verificar, as variações do nome, a relação de todos os trabalhos com texto completo bem como um quadro resumo numérico; há links para o Currículo Lattes e o Google Acadêmico ( quando esse for informado).

ATENÇÃO!

ESTE TEXTO "AJUDA" ESTÁ SUJEITO A ATUALIZAÇÕES CONSTANTES, A MEDIDA QUE NOVAS FUNCIONALIDADES E RECURSOS DE BUSCA FOREM SENDO DESENVOLVIDOS PELAS EQUIPES DA BIBLIOTECA E DA INFORMÁTICA.

O gerenciamento do Repositório está a cargo da Biblioteca do IPEN. Constam neste RI, até o presente momento 20.950 itens que tanto podem ser artigos de periódicos ou de eventos nacionais e internacionais, dissertações e teses, livros, capítulo de livros e relatórios técnicos. Para participar do RI-IPEN é necessário que pelo menos um dos autores tenha vínculo acadêmico ou funcional com o Instituto. Nesta primeira etapa de funcionamento do RI, a coleta das publicações é realizada periodicamente pela equipe da Biblioteca do IPEN, extraindo os dados das bases internacionais tais como a Web of Science, Scopus, INIS, SciElo além de verificar o Currículo Lattes. O RI-IPEN apresenta também um aspecto inovador no seu funcionamento. Por meio de metadados específicos ele está vinculado ao sistema de gerenciamento das atividades do Plano Diretor anual do IPEN (SIGEPI). Com o objetivo de fornecer dados numéricos para a elaboração dos indicadores da Produção Cientifica Institucional, disponibiliza uma tabela estatística registrando em tempo real a inserção de novos itens. Foi criado um metadado que contém um número único para cada integrante da comunidade científica do IPEN. Esse metadado se transformou em um filtro que ao ser acionado apresenta todos os trabalhos de um determinado autor independente das variáveis na forma de citação do seu nome.

A elaboração do projeto do RI do IPEN foi iniciado em novembro de 2013, colocado em operação interna em julho de 2014 e disponibilizado na Internet em junho de 2015. Utiliza o software livre Dspace, desenvolvido pelo Massachusetts Institute of Technology (MIT). Para descrição dos metadados adota o padrão Dublin Core. É compatível com o Protocolo de Arquivos Abertos (OAI) permitindo interoperabilidade com repositórios de âmbito nacional e internacional.

1. Portaria IPEN-CNEN/SP nº 387, que estabeleceu os princípios que nortearam a criação do RDI, clique aqui.


2. A experiência do Instituto de Pesquisas Energéticas e Nucleares (IPEN-CNEN/SP) na criação de um Repositório Digital Institucional – RDI, clique aqui.

O Repositório Digital do IPEN é um equipamento institucional de acesso aberto, criado com o objetivo de reunir, preservar, disponibilizar e conferir maior visibilidade à Produção Científica publicada pelo Instituto, desde sua criação em 1956.

Operando, inicialmente como uma base de dados referencial o Repositório foi disponibilizado na atual plataforma, em junho de 2015. No Repositório está disponível o acesso ao conteúdo digital de artigos de periódicos, eventos, nacionais e internacionais, livros, capítulos, dissertações, teses e relatórios técnicos.

A elaboração do projeto do RI do IPEN foi iniciado em novembro de 2013, colocado em operação interna em julho de 2014 e disponibilizado na Internet em junho de 2015. Utiliza o software livre Dspace, desenvolvido pelo Massachusetts Institute of Technology (MIT). Para descrição dos metadados adota o padrão Dublin Core. É compatível com o Protocolo de Arquivos Abertos (OAI) permitindo interoperabilidade com repositórios de âmbito nacional e internacional.

O gerenciamento do Repositório está a cargo da Biblioteca do IPEN. Constam neste RI, até o presente momento 20.950 itens que tanto podem ser artigos de periódicos ou de eventos nacionais e internacionais, dissertações e teses, livros, capítulo de livros e relatórios técnicos. Para participar do RI-IPEN é necessário que pelo menos um dos autores tenha vínculo acadêmico ou funcional com o Instituto. Nesta primeira etapa de funcionamento do RI, a coleta das publicações é realizada periodicamente pela equipe da Biblioteca do IPEN, extraindo os dados das bases internacionais tais como a Web of Science, Scopus, INIS, SciElo além de verificar o Currículo Lattes. O RI-IPEN apresenta também um aspecto inovador no seu funcionamento. Por meio de metadados específicos ele está vinculado ao sistema de gerenciamento das atividades do Plano Diretor anual do IPEN (SIGEPI). Com o objetivo de fornecer dados numéricos para a elaboração dos indicadores da Produção Cientifica Institucional, disponibiliza uma tabela estatística registrando em tempo real a inserção de novos itens. Foi criado um metadado que contém um número único para cada integrante da comunidade científica do IPEN. Esse metadado se transformou em um filtro que ao ser acionado apresenta todos os trabalhos de um determinado autor independente das variáveis na forma de citação do seu nome.