Navegação Eventos - Artigos por Autores IPEN "ZEZELL, DENISE"

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  • IPEN-DOC 29345

    FERREIRA, MARIA C.C.; MONTEIRO, GABRIELA R.; PERALTA, FELIPE; CASTRO, PEDRO A.A. ; ZEZELL, DENISE ; NOGUEIRA, MARCELO S.; CARVALHO, LUIS F.C.S.. Assessment of bound water of saliva samples by using FT-IR spectroscopy. In: LATIN AMERICA OPTICS AND PHOTONICS CONFERENCE, August 7-11, 2022, Recife, PE. Proceedings... Washington, DC, USA: Optica Publishing Group, 2022. DOI: 10.1364/LAOP.2022.M4B.1

    Abstract: The objective of the present work is to show the relationship of the high-wavenumber spectral region concern OH vibrations, which show in a way how bound water can be altered in different sample groups.

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  • IPEN-DOC 25607

    CASTRO, PEDRO ; ZORN, TELMA; ZEZELL, DENISE . Biochemical characterization of skin burn wound healing using ATR-FTIR. In: SBFOTON INTERNATIONAL OPTICS AND PHOTONICS CONFERENCE, October 08-10, 2018, Campinas, SP. Proceedings... Piscataway, NJ, USA: IEEE, 2018. DOI: 10.1109/SBFoton-IOPC.2018.8610943

    Abstract: Efficient biochemical characterization of skin burn healing stages can improve clinical routine to adjust patients treatment. The golden standard for diagnosing skin burning stages is the histological biopsy. This practice is often expensive and technically challenging. There have been advances in the treatment, and diagnostic of the critical skin burned patients due to the increase of multidisciplinary collaboration. The contributions from different fields of biomedical engineering motivate to develop a better procedure for clinical applications. Considering the difficulty of monitoring wound healing the Fourier Transform Infrared coupled with an Attenuated Total Reflectance (ATR-FTIR) accessory is an analytical technique that can provide information regarding spectral biomarkers in biological materials. This study aimed to evaluate the classification feasibility provided by ATR-FTIR technique in the burned skin to follow the regenerative process in vivo. 40 skin burned samples from the Wistar rats dorsum at 3,7, 14, 21 days after burn were compared with the corresponded healthy group samples, by registering their infrared absorption spectra in FTIR Thermo Nicolet 6700 coupled to a diamond crystal ATR. The spectra were separated in the region 900 to 1800 cm-1 for further chemometric calculations. The second derivative of spectra was applied for discrimination, which results demonstrated differences from control and burns wounded groups, as well as among, burn wounded groups, using Amide I (1628 cm-1) and Amide II (1514 cm-1) bands. Amide I and Amide II bands are two significant bands of the infrared protein spectrum. The Amide I band is mainly associated with the C=O stretching vibration (70-80%) and is directly related to the backbone conformation. The Amide II band results from the N-H bending vibration (40-60%) and from the C-N stretching vibration (18-40%). This band is conformationally sensitive. These bands suggest proteins activity changing associate to inflammatory and maturation stages when it is compared with the healthy group. The statistical difference with amide I occur in proliferation and maturation stages. These findings indicate that ATR-FTIR is suitable to detect the burn wound healing stages and in the future can be an auxiliary instrument for clinical routine.

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  • IPEN-DOC 22900

    LIMA, CASSIO A. ; GOULART, VIVIANE ; ZEZELL, DENISE . Chemometric methods applied to FTIR spectra to discriminate treated and non-treated cutaneous malignant lesions from healthy skin. In: LATIN AMERICA OPTICS AND PHOTONICS CONFERENCE, August 22-26, 2016, Medellín, Colombia. Proceedings... Washington, DC, USA: OSA, 2016.

    Abstract: Chemometric methods were used to differentiate FTIR spectra of treated and nontreated malignant lesions from healthy skin. We conclude that the method can be used to evaluate the biological changes promoted by photodynamic treatment.

    Palavras-Chave: skin; formation damage; melanomas; chemotherapy; photodynamic therapy

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  • IPEN-DOC 28104

    CASTRO, PEDRO ; ZORN, TELMA; ZEZELL, DENISE . Healing status of bum wound healing: ATR-FTIR study. In: SBFOTON INTERNATIONAL OPTICS AND PHOTONICS CONFERENCE, May 31 - June 2, 2021, Online. Proceedings... Piscataway, NJ, USA: IEEE, 2021. DOI: 10.1109/SBFotonIOPC50774.2021.9461956

    Abstract: The purpose of this study is to use infrared spectroscopy (FTIR) for monitoring biological changes in burned skin. Wistar rats dorsum samples were compared to healthy group samples at 7, 14, 21 days after burn. Proteins changes of burn wounds were monitored by area under the curve (AUC) of bands at 1630 cm 1 , 1543 cm 1 and 1743 cm 1 . Kruskal-Wallis normality tests, unpaired t test with Welch's correction were used to evaluate the differences between AUC. These bands suggest association between collagen activity during wound healing stages. Our result indicates progressive recovery of 7,14 and 21 days tissues when compared with the healthy group.

    Palavras-Chave: fourier transformation; infrared spectra; animal tissues; biological recovery; healing; fourier transform spectrometers; skin; burns

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  • IPEN-DOC 16039

    SANTOS, MOISES O. dos; PELEGATI, VITOR B.; CESAR, CARLOS L.; ZORN, TELMA M.T.; ZEZELL, DENISE . Imaging of third-degree burned skin by two-photon emission fluorescence microscope and second harmonic generation microscopy. In: LATIN AMERICA OPTICS AND PHOTONICS CONFERENCE, September 27-30, 2010, Recife, PE. Abstracts... 2010.

    Palavras-Chave: skin; burns; wounds; fluorescence; multi-photon processes; microscopy; harmonic generation

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  • IPEN-DOC 25606

    LIMA, CASSIO ; CORREA, LUCIANA; BYRNE, HUGH; ZEZELL, DENISE . K-means and Hierarchical Cluster Analysis as segmentation algorithms of FTIR hyperspectral images collected from cutaneous tissue. In: SBFOTON INTERNATIONAL OPTICS AND PHOTONICS CONFERENCE, October 08-10, 2018, Campinas, SP. Proceedings... Piscataway, NJ, USA: IEEE, 2018. DOI: 10.1109/SBFoton-IOPC.2018.8610920

    Abstract: Fourier Transform Infrared (FTIR) spectroscopy is a rapid and label-free analytical technique whose potential as a diagnostic tool has been well demonstrated. The combination of spectroscopy and microscopy technologies enable wide-field scanning of a sample, providing a hyperspectral image with tens of thousands of spectra in a few minutes. In order to increase the information content of FTIR images, different clustering algorithms have been proposed as segmentation methods. However, systematic comparative tests of these techniques are still missing. Thus, the present paper aims to compare the ability of K-means Cluster Analysis (KMCA) and Hierarchical Cluster Analysis (HCA) as clustering algorithms to reconstruct FTIR hyperspectral images. Spectra for cluster analysis were acquired from healthy cutaneous tissue and the pseudo-color reconstructed images were compared to standard histopathology in order to assess the number of clusters required by both methods to correctly identify the morphological skin components (stratum corneum, epithelium, dermis and hypodermis).

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O gerenciamento do Repositório está a cargo da Biblioteca do IPEN. Constam neste RI, até o presente momento 20.950 itens que tanto podem ser artigos de periódicos ou de eventos nacionais e internacionais, dissertações e teses, livros, capítulo de livros e relatórios técnicos. Para participar do RI-IPEN é necessário que pelo menos um dos autores tenha vínculo acadêmico ou funcional com o Instituto. Nesta primeira etapa de funcionamento do RI, a coleta das publicações é realizada periodicamente pela equipe da Biblioteca do IPEN, extraindo os dados das bases internacionais tais como a Web of Science, Scopus, INIS, SciElo além de verificar o Currículo Lattes. O RI-IPEN apresenta também um aspecto inovador no seu funcionamento. Por meio de metadados específicos ele está vinculado ao sistema de gerenciamento das atividades do Plano Diretor anual do IPEN (SIGEPI). Com o objetivo de fornecer dados numéricos para a elaboração dos indicadores da Produção Cientifica Institucional, disponibiliza uma tabela estatística registrando em tempo real a inserção de novos itens. Foi criado um metadado que contém um número único para cada integrante da comunidade científica do IPEN. Esse metadado se transformou em um filtro que ao ser acionado apresenta todos os trabalhos de um determinado autor independente das variáveis na forma de citação do seu nome.

A elaboração do projeto do RI do IPEN foi iniciado em novembro de 2013, colocado em operação interna em julho de 2014 e disponibilizado na Internet em junho de 2015. Utiliza o software livre Dspace, desenvolvido pelo Massachusetts Institute of Technology (MIT). Para descrição dos metadados adota o padrão Dublin Core. É compatível com o Protocolo de Arquivos Abertos (OAI) permitindo interoperabilidade com repositórios de âmbito nacional e internacional.

1. Portaria IPEN-CNEN/SP nº 387, que estabeleceu os princípios que nortearam a criação do RDI, clique aqui.


2. A experiência do Instituto de Pesquisas Energéticas e Nucleares (IPEN-CNEN/SP) na criação de um Repositório Digital Institucional – RDI, clique aqui.

O Repositório Digital do IPEN é um equipamento institucional de acesso aberto, criado com o objetivo de reunir, preservar, disponibilizar e conferir maior visibilidade à Produção Científica publicada pelo Instituto, desde sua criação em 1956.

Operando, inicialmente como uma base de dados referencial o Repositório foi disponibilizado na atual plataforma, em junho de 2015. No Repositório está disponível o acesso ao conteúdo digital de artigos de periódicos, eventos, nacionais e internacionais, livros, capítulos, dissertações, teses e relatórios técnicos.

A elaboração do projeto do RI do IPEN foi iniciado em novembro de 2013, colocado em operação interna em julho de 2014 e disponibilizado na Internet em junho de 2015. Utiliza o software livre Dspace, desenvolvido pelo Massachusetts Institute of Technology (MIT). Para descrição dos metadados adota o padrão Dublin Core. É compatível com o Protocolo de Arquivos Abertos (OAI) permitindo interoperabilidade com repositórios de âmbito nacional e internacional.

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