INSTITUTO DE PESQUISAS ENERGÉTICAS E NUCLEARES
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Navegação Eventos - Resumos por título da publicação "Molecular pathology via infrared spectral imaging for skin cancer diagnosis"

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  • IPEN-DOC 26007

    LIMA, CASSIO ; BYRNE, HUGH; CORREA, LUCIANA; ZEZELL, DENISE . Molecular pathology via infrared spectral imaging for skin cancer diagnosis. In: ENCONTRO DE OUTONO DA SOCIEDADE BRASILEIRA DE FÍSICA, 42., 26-31 de maio, 2019, Aracaju, SE. Resumo... São Paulo: Sociedade Brasileira de Física, 2019.

    Abstract: Fourier Transform Infrared (FTIR) spectroscopy is a rapid and label-free analytical technique that provide information about the overall biochemical pro¯le of biological samples based on the vibrations of its basic molecular components (carbohydrates, proteins, lipids and nucleic acids) that are infrared active. The potential biomedical applications of FTIR spectroscopy as a tool for cancer diagnosis have been well demonstrated over the last years. However, most studies have focused on evaluate the diagnostic ability of FTIR by comparing healthy tissue to cancers on advanced stage and few studies have centered on evaluating the early stages of cancer. Thus, the present study aims to demonstrate the ability of FTIR spectroscopy to discriminate healthy skin from advanced skin cancer (squamous cell carcinoma) as well as from early stages of malignancy using the information retained by spectral data. Cutaneous neoplastic lesions were chemically-induced on Swiss mice using a well-stablished two-stage carcinogenesis protocol. Healthy tissue was collected from animals non-exposed to chemicals and di®erent disease stages were obtained by varying the exposure time of animals to carcinogenenic factors. Tissue sections were obtained from formalin-¯xed para±n-embedded (FFPE) and placed on calcium °uoride substrates. FTIR hyperspectral images were acquired in transmission mode over mid-infrared spectral region and compared using Principal Components Analysis (PCA) associated to Linear Discriminant Analysis (PC-LDA). Satisfactory data discrimination (accuracy, sensitivity and speci¯city) was achieved by PC-LDA and the variables responsible by classi¯cation were evaluated in order to assess the spectral changes of skin components during the transition of healthy into diseased state. Our ¯ndings demonstrate the potential of FTIR spectroscopy not only for skin cancer diagnosis, but also to evaluate the biochemical events triggered by cancer without requiring laborious and time-consuming procedures or expensive labeled probes as biomarkers.

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Buscar os artigos apresentados em um evento internacional de 2015, sobre loss of coolant, do autor Maprelian.

Autor: Maprelian

Título: loss of coolant

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Ano de publicação: 2015

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O gerenciamento do Repositório está a cargo da Biblioteca do IPEN. Constam neste RI, até o presente momento 20.950 itens que tanto podem ser artigos de periódicos ou de eventos nacionais e internacionais, dissertações e teses, livros, capítulo de livros e relatórios técnicos. Para participar do RI-IPEN é necessário que pelo menos um dos autores tenha vínculo acadêmico ou funcional com o Instituto. Nesta primeira etapa de funcionamento do RI, a coleta das publicações é realizada periodicamente pela equipe da Biblioteca do IPEN, extraindo os dados das bases internacionais tais como a Web of Science, Scopus, INIS, SciElo além de verificar o Currículo Lattes. O RI-IPEN apresenta também um aspecto inovador no seu funcionamento. Por meio de metadados específicos ele está vinculado ao sistema de gerenciamento das atividades do Plano Diretor anual do IPEN (SIGEPI). Com o objetivo de fornecer dados numéricos para a elaboração dos indicadores da Produção Cientifica Institucional, disponibiliza uma tabela estatística registrando em tempo real a inserção de novos itens. Foi criado um metadado que contém um número único para cada integrante da comunidade científica do IPEN. Esse metadado se transformou em um filtro que ao ser acionado apresenta todos os trabalhos de um determinado autor independente das variáveis na forma de citação do seu nome.

A elaboração do projeto do RI do IPEN foi iniciado em novembro de 2013, colocado em operação interna em julho de 2014 e disponibilizado na Internet em junho de 2015. Utiliza o software livre Dspace, desenvolvido pelo Massachusetts Institute of Technology (MIT). Para descrição dos metadados adota o padrão Dublin Core. É compatível com o Protocolo de Arquivos Abertos (OAI) permitindo interoperabilidade com repositórios de âmbito nacional e internacional.

1. Portaria IPEN-CNEN/SP nº 387, que estabeleceu os princípios que nortearam a criação do RDI, clique aqui.


2. A experiência do Instituto de Pesquisas Energéticas e Nucleares (IPEN-CNEN/SP) na criação de um Repositório Digital Institucional – RDI, clique aqui.

O Repositório Digital do IPEN é um equipamento institucional de acesso aberto, criado com o objetivo de reunir, preservar, disponibilizar e conferir maior visibilidade à Produção Científica publicada pelo Instituto, desde sua criação em 1956.

Operando, inicialmente como uma base de dados referencial o Repositório foi disponibilizado na atual plataforma, em junho de 2015. No Repositório está disponível o acesso ao conteúdo digital de artigos de periódicos, eventos, nacionais e internacionais, livros, capítulos, dissertações, teses e relatórios técnicos.

A elaboração do projeto do RI do IPEN foi iniciado em novembro de 2013, colocado em operação interna em julho de 2014 e disponibilizado na Internet em junho de 2015. Utiliza o software livre Dspace, desenvolvido pelo Massachusetts Institute of Technology (MIT). Para descrição dos metadados adota o padrão Dublin Core. É compatível com o Protocolo de Arquivos Abertos (OAI) permitindo interoperabilidade com repositórios de âmbito nacional e internacional.

O gerenciamento do Repositório está a cargo da Biblioteca do IPEN. Constam neste RI, até o presente momento 20.950 itens que tanto podem ser artigos de periódicos ou de eventos nacionais e internacionais, dissertações e teses, livros, capítulo de livros e relatórios técnicos. Para participar do RI-IPEN é necessário que pelo menos um dos autores tenha vínculo acadêmico ou funcional com o Instituto. Nesta primeira etapa de funcionamento do RI, a coleta das publicações é realizada periodicamente pela equipe da Biblioteca do IPEN, extraindo os dados das bases internacionais tais como a Web of Science, Scopus, INIS, SciElo além de verificar o Currículo Lattes. O RI-IPEN apresenta também um aspecto inovador no seu funcionamento. Por meio de metadados específicos ele está vinculado ao sistema de gerenciamento das atividades do Plano Diretor anual do IPEN (SIGEPI). Com o objetivo de fornecer dados numéricos para a elaboração dos indicadores da Produção Cientifica Institucional, disponibiliza uma tabela estatística registrando em tempo real a inserção de novos itens. Foi criado um metadado que contém um número único para cada integrante da comunidade científica do IPEN. Esse metadado se transformou em um filtro que ao ser acionado apresenta todos os trabalhos de um determinado autor independente das variáveis na forma de citação do seu nome.